สาเหตุของการเกิดโรคเกิดขึ้นได้หลายสาเหตุ แต่จะแบ่งสาเหตุการเกิดโรคเป็น 3 ช่วงใหญ่ๆคือ

1.ช่วงที่เด็กอยู่ในครรภ์มารดา ได้แก่ มีความผิดปกติของสมองตั้งแต่กำเนิด, มีความผิดปกติของโครโมโซม,
เด็กขาดออกซิเจนขณะอยู่ในครรภ์เกิดจากภาวะเลือดออกระหว่างครรภ์ และ ได้รับสารพิษจากมารดา(บุหรี่, สุรา) เป็นต้น

2.ช่วงคลอด ได้แก่ เด็กคลอดก่อนกำหนดหรือเด็กที่มีน้ำหนักตัวน้อย (น้อยกว่า 2500 กรัม)
เด็กขาดออกซิเจนขณะคลอดจากท่าคลอดที่ลำบากหรือท่าคลอดที่ผิดปกติ เป็นต้น

3.ช่วงหลังคลอด ได้แก่ เด็กขาดออกซิเจนจากภาวะชัก, เด็กเกิดการติดเชื้อและการเกิดอุบัติเหตุที่ทำอันตรายต่อสมอง ซึ่งสาเหตุที่กล่าวมาทั้งหมดส่งผลทำให้เด็กมีความผิดปกติ กล้ามเนื้อมีอาการเกร็ง บางรายมีอาการกล้ามเนื้ออ่อนแรงหรือบางรายมีอาการกล้ามเนื้อเกร็งสลับกับกล้ามเนื้ออ่อนแรงเป็นช่วงๆ ส่งผลทำให้เกิดการเคลื่อนไหวที่ไม่ปกติ รบกวนการใช้ชีวิตประจำวัน ในกิจกรรมต่างๆ เช่น การนอน การตั้งคลาน การนั่ง การยืน และการเดิน เป็นต้น

ทางด้านร่างกาย

การนั่งบนหลังม้า ซึ่งเป็นกิจกรรมหลักในอาชาบำบัดเป็นการกระตุ้นกล้ามเนื้อส่วนต่างๆ ของเด็กๆ ให้เคลื่อนไหวเป็นจังหวะ เพราะต้องขยับเขยื้อนร่างกายตลอดเวลา เนื่องจากสัญชาตญาณของมนุษย์ที่พยายามจะรักษาสมดุลของร่างกายไม่ให้ตกลงมาจากหลังม้า ซึ่งสามารถช่วยลดอาการเกร็งต่างๆ ได้เป็นอย่างดี เสมือนการทำกายภาพบำบัดรูปแบบหนึ่ง ช่วยส่งเสริมการทำงานของระบบร่างกายต่างๆให้สัมพันธ์กันมากขึ้นอีกด้วย 

ทางด้านจิตใจและอารมณ์

ช่วยสร้างสมาธิ ฝึกควบคุมอารมณ์ ช่วยให้เด็กพิเศษอยู่นิ่งได้นานขึ้น  เพราะระหว่างขี่ม้า เด็กต้องมีสมาธิจดจ่อ จึงเหมาะสำหรับเด็กพิเศษกลุ่มออทิสติกและสมาธิสั้น

ทางด้านสังคม

เข้าร่วมกิจกรรมนี้ต้องทำมีปฎิสัมพันธ์ทั้งกับผู้คนและม้า โดยความรู้จักกับม้า ครูฝึก และเพื่อนๆ ร่วมกิจกรรม ช่วยให้เด็กเรียนรู้ทักษะทางสัมคมได้มากขึ้น